Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BEX3Q00994 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BEX3Q00994 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms