Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRF9Q00978 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms