Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK6Q00534 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms