Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VLDLRP98155 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VLDLRP98155 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VLDLRP98155 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms