Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX1P83916 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX1P83916 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX1P83916 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX1P83916 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX1P83916 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX1P83916 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX1P83916 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX1P83916 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX1P83916 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms