Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX1P78414 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX1P78414 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRX1P78414 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRX1P78414 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRX1P78414 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRX1P78414 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRX1P78414 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRX1P78414 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX1P78414 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX1P78414 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms