Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms