Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HBBP68871 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HBBP68871 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBBP68871 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBBP68871 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBBP68871 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBBP68871 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBBP68871 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms