Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMC1P62191 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMC1P62191 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMC1P62191 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms