Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP46P62068 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP46P62068 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP46P62068 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP46P62068 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP46P62068 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP46P62068 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP46P62068 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms