Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB2AP61019 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms