Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00315P59091 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00315P59091 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms