Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEFSECP57772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEFSECP57772 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms