Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMDP57764 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms