Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP107P57740 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP107P57740 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP107P57740 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms