Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX10P56693 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX10P56693 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX10P56693 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX10P56693 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX10P56693 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX10P56693 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX10P56693 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms