Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RRP1P56182 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RRP1P56182 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RRP1P56182 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RRP1P56182 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RRP1P56182 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RRP1P56182 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RRP1P56182 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP1P56182 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP1P56182 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP1P56182 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms