Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ELLP55199 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ELLP55199 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ELLP55199 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ELLP55199 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ELLP55199 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ELLP55199 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ELLP55199 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ELLP55199 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms