Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A2P55011 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms