Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIF1P55008 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIF1P55008 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIF1P55008 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIF1P55008 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AIF1P55008 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AIF1P55008 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIF1P55008 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms