Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRRX1P54821 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRRX1P54821 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms