Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms