Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3M2P53677 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms