Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARFIP2P53365 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARFIP2P53365 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms