Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAP1GDS1P52306 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms