Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP11P51784 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP11P51784 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP11P51784 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP11P51784 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP11P51784 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP11P51784 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP11P51784 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP11P51784 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP11P51784 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP11P51784 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP11P51784 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms