Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DAP3P51398 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DAP3P51398 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DAP3P51398 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DAP3P51398 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DAP3P51398 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms