Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCNN1GP51170 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms