Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT8P50990 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCT8P50990 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCT8P50990 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCT8P50990 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCT8P50990 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCT8P50990 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCT8P50990 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms