Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERFP50548 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERFP50548 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERFP50548 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERFP50548 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERFP50548 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERFP50548 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERFP50548 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms