Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF6P49848 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF6P49848 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF6P49848 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF6P49848 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF6P49848 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF6P49848 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF6P49848 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF6P49848 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF6P49848 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms