Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN2P49810 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN2P49810 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms