Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLK2P49760 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK2P49760 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK2P49760 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK2P49760 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK2P49760 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK2P49760 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK2P49760 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLK2P49760 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK2P49760 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK2P49760 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK2P49760 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLK2P49760 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms