Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HARS2P49590 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HARS2P49590 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HARS2P49590 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HARS2P49590 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HARS2P49590 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HARS2P49590 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HARS2P49590 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HARS2P49590 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HARS2P49590 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
HARS2P49590 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HARS2P49590 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms