Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFMP49411 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFMP49411 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUFMP49411 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUFMP49411 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUFMP49411 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUFMP49411 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUFMP49411 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUFMP49411 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUFMP49411 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms