Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTBP49356 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTBP49356 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNTBP49356 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNTBP49356 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FNTBP49356 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNTBP49356 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNTBP49356 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNTBP49356 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNTBP49356 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms