Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NESP48681 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NESP48681 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NESP48681 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NESP48681 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NESP48681 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NESP48681 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NESP48681 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NESP48681 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NESP48681 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NESP48681 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NESP48681 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NESP48681 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NESP48681 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NESP48681 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NESP48681 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NESP48681 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NESP48681 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NESP48681 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NESP48681 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NESP48681 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NESP48681 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NESP48681 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NESP48681 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NESP48681 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NESP48681 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NESP48681 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NESP48681 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms