Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRIP1P48552 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NRIP1P48552 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms