Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSSP48449 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSSP48449 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSSP48449 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSSP48449 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSSP48449 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSSP48449 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSSP48449 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LSSP48449 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSSP48449 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSSP48449 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSSP48449 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms