Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A11P48066 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A11P48066 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms