Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA4P48058 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA4P48058 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms