Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKI67P46013 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKI67P46013 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKI67P46013 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MKI67P46013 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKI67P46013 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKI67P46013 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms