Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSOP43234 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSOP43234 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSOP43234 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSOP43234 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSOP43234 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSOP43234 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSOP43234 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSOP43234 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSOP43234 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSOP43234 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSOP43234 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSOP43234 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSOP43234 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSOP43234 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSOP43234 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms