Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX2P40425 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PBX2P40425 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX2P40425 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX2P40425 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX2P40425 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX2P40425 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX2P40425 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX2P40425 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms