Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGCXP38435 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGCXP38435 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGCXP38435 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGCXP38435 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGCXP38435 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGCXP38435 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGCXP38435 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGCXP38435 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGCXP38435 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGCXP38435 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGCXP38435 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGCXP38435 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGCXP38435 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms