Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LTBRP36941 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LTBRP36941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LTBRP36941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LTBRP36941 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LTBRP36941 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LTBRP36941 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LTBRP36941 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms