Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD12P35452 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms