Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDXP35241 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDXP35241 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDXP35241 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDXP35241 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDXP35241 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDXP35241 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDXP35241 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDXP35241 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDXP35241 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDXP35241 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDXP35241 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms