Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF2P35227 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms