Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNA1P35221 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNA1P35221 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms